Промотор (биология)

Промотор - регулаторна ДНК област, разположена в предната част (посока на 5 'края на молекулата) отворена четяща рамка на гена или оперона в началото, като се гарантира контрол на транскрипцията на гена или оперона. Всеки ген или оперон може да има повече от един промотор, регулира отделно един от друг, и в допълнение, други регулаторни области. Изисква се промотор за иницииране на транскрипцията.







прокариоти

Структура на бактериален промотор

Типични бактериален промотор съдържа последователност 2:

  • в позиция 10 (десет нуклеотида от началния кодон ATG) - последователност ТАТААТ (Pribnou кутия)
  • при позиция -35 - последователност TTGATSA

Тези последователности са консервативни, но различни нуклеотиди могат да варират в различни видове и гени. Освен това, тези елементи са признати само сигма субединица на РНК полимераза, 70 Ша изоформа друга разпознае други последователности.

Други регулаторни последователности могат да бъдат разположени в близост до промотора: операторите цис-елементи. Гените в бактерии често се комбинират оперон - група от гени, кодиращи определен биохимичен път съвместно регулира и разположени близо един до друг върху хромозомата. Operon може да има един или повече организаторите. Лактаза оперон, който за първи път е описан, има само един промотор, при което ген се транскрибира три.

иницииране на транскрипция







Промоторът е призната от започване на транскрипция фактор - сигма субединицата на РНК полимераза. Докато сигма субединица е в комплекс с полимераза, тя преминава през ДНК последователността, докато удари промотор последователност, която тя най-свързани. Деактивирането на коефициента на започване на промотора настъпва едновременно с удължението на транскрипция.

Промоторите могат да имат различни "мощност промотор", т.е., да се свързва с полимераза комплекс РНК с различна ефективност. Слаби организаторите изискват допълнителни фактори за започване на транскрипцията. промотор сила зависи също от степента на ДНК супернавиване бактериална: в присъствието на отрицателно усукана молекула, тя започва да се топи и транскрипцията започва бързо.

Евкариотни клетки са 3 класа на РНК полимераза, всяка от които има свои собствени промотори и механизми транскрипция иницииране.

Структурата на промотора на РНК полимераза II

Промотори на РНК полимераза II обикновено съдържат три групи компоненти: проксималната, дисталната и базално. Проксималната намира в областта между -200 и -50 нуклеотиди нагоре на транскрипцията начална точка. Дистална може да бъде навсякъде.

Към основните промоторни елементи включват:

  • TATA кутия, в която се намира на около -30 нуклеотиди от самото начало
  • начален елемент - около началото
  • елемент надолу по веригата (DPE, по веригата промоторен елемент) - около 30 базови двойки от началото
  • GC-кутия, която се намира над кутията TATA.

Не всички еукариотни гени имат такива елементи.

иницииране на транскрипция

В еукариоти, РНК полимераза II, който е отговорен за синтеза на най-кодиране без РНК и РНК е протеинов комплекс на 12 субединици. За да инициира транскрипция на промотора трябва да отговаря на предварително започване комплекс от 6 субединици.

С TATA кутия свързан протеин ТВР на (Engl. TATA кутия свързващ протеин), който се развива ДНК на мястото на промотора. Този протеин има няколко кофактори учат, че други промоторни области (елемент надолу, GC-кутия), ако конкретен ген има кутия TATA.